FireProt-ASR

FireProt-ASR

software

Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek

Musil Miloš, Ing., Ph.D. (UIFS)
Khan Rayyan
Beier Andy, Dr.
Štourač Jan (FIT)
Konegger Hannes
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (UMEL)
Bednář David (FIT)

proteinové inženýrství, thermostabiliní proteiny, ancestrální rekonstrukce, evoluční design, stabilita proteinů

FireProt-ASR je webová služba sloužící k plně automatizovanému použití ancestrální rekonstrukce. FireProt-ASR dovoluje uživatelům provést ancestrální rekonstrukci s využitím pouze jediné startovní sekvence. Nástroj nejprve zkompiluje ataset katalyticky relevantních proteinů a tento dataset následně zredukuje na požadovanou velikost biologicky relevantních sekvencí. Sekvence jsou následně zarovnány, je zkonstruován fylogenetický strom a je provedena rekonstrukce ancestrálních uzlů společně s opravou ancestrálních mezer. Uživateli je rovněž dovoleno použít vlastní data a zahájit výpočet z různých částí výpočetního prostředí.

Nástroj je dostupný na internetové adrese: http://loschmidt.chemi.muni.cz/fireprotasr

Nástroje, metody a technologie ICT pro podporu konceptu smart cities, VUT, Vnitřní projekty VUT, FIT-S-17-3964, 2017-2020, ukončen

Výzkumná skupina informačních a databázových systémů (VZ IS)

Ústav informačních systémů (UIFS)