Detail publikace

A flexible technique for the automatic design of approximate string matching architectures

MARTÍNEK, T.; LEXA, M.; KOŘENEK, J.; FUČÍK, O. A flexible technique for the automatic design of approximate string matching architectures. In Proc. of 2006 IEEE Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems Workshop. Praha: IEEE Computer Society, 2006. p. 83-84. ISBN: 1-4244-0184-4.
Název česky
Flexibilní technika pro automatické navrhování architektur pro hledání podobnosti řetězců
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
anglicky
Autoři
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (UPSY)
Kořenek Jan, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Fučík Otto, doc. Dr. Ing. (UPSY)
Klíčová slova

Appriximate string matching, Systolic array architecture, FPGA, DNA sequence analysis

Abstrakt

Systolické architektury pro hledání řetězců na základě jejichpodobnosti hrají významnou roli jako akcelerátory pro řadu biologickýchaplikací. Avšak jejich široké nasazení je v současné době omezenonedostatečnou flexibilitou, která je požadována ze strany častoproměnlivých úloh. S ohledem na tuto skutečnost vzniká potřeba vyvíjetnové postupy a metody pro automatické navrhování a implementaci těchtoarchitektur s cílem dosáhnout vysokého výkonnu a efektivity. Tentočlánek prezentuje významnou část takovéto metody pro výpočet parametrůgenerické architektury systolického pole s ohledem na dosaženímaximálního výkonu a efektivního využití dostupných zdrojů.

Rok
2006
Strany
83–84
Sborník
Proc. of 2006 IEEE Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems Workshop
Konference
IEEE Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems Workshop, Praha, CZ
ISBN
1-4244-0184-4
Vydavatel
IEEE Computer Society
Místo
Praha
DOI
10.1109/DDECS.2006.1649579
UT WoS
000238973400021
BibTeX 
@inproceedings{BUT22395,
  author="Tomáš {Martínek} and Matej {Lexa} and Jan {Kořenek} and Otto {Fučík}",
  title="A flexible technique for the automatic design of approximate string matching architectures",
  booktitle="Proc. of 2006 IEEE Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems Workshop",
  year="2006",
  pages="83--84",
  publisher="IEEE Computer Society",
  address="Praha",
  doi="10.1109/DDECS.2006.1649579",
  isbn="1-4244-0184-4"
}
Nahoru