Detail publikace

A flexible technique for the automatic design of approximate string matching architectures

MARTÍNEK, T.; LEXA, M.; KOŘENEK, J.; FUČÍK, O. A flexible technique for the automatic design of approximate string matching architectures. In Proc. of 2006 IEEE Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems Workshop. Praha: IEEE Computer Society, 2006. p. 83-84. ISBN: 1-4244-0184-4.
Název česky
Flexibilní technika pro automatické navrhování architektur pro hledání podobnosti řetězců
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
anglicky
Autoři
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (DFIT-děkan)
Kořenek Jan, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Fučík Otto, doc. Dr. Ing. (UPSY)
Klíčová slova

Appriximate string matching, Systolic array architecture, FPGA, DNA sequence analysis

Abstrakt

Systolické architektury pro hledání řetězců na základě jejich podobnosti hrají významnou roli jako akcelerátory pro řadu biologických aplikací. Avšak jejich široké nasazení je v současné době omezeno nedostatečnou flexibilitou, která je požadována ze strany často proměnlivých úloh. S ohledem na tuto skutečnost vzniká potřeba vyvíjet nové postupy a metody pro automatické navrhování a implementaci těchto architektur s cílem dosáhnout vysokého výkonnu a efektivity. Tento článek prezentuje významnou část takovéto metody pro výpočet parametrů generické architektury systolického pole s ohledem na dosažení maximálního výkonu a efektivního využití dostupných zdrojů.

Rok
2006
Strany
83–84
Sborník
Proc. of 2006 IEEE Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems Workshop
ISBN
1-4244-0184-4
Vydavatel
IEEE Computer Society
Místo
Praha
BibTeX 
@inproceedings{BUT22395,
  author="Tomáš {Martínek} and Matej {Lexa} and Jan {Kořenek} and Otto {Fučík}",
  title="A flexible technique for the automatic design of approximate string matching architectures",
  booktitle="Proc. of 2006 IEEE Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems Workshop",
  year="2006",
  pages="83--84",
  publisher="IEEE Computer Society",
  address="Praha",
  isbn="1-4244-0184-4"
}
Nahoru