Project Details
Metody zpracování a vizualizace dat nanopórové sekvenace pro účely metagenomiky
Project Period: 1. 3. 2017 – 28. 2. 2018
Project Type: grant
Code: FEKT/FIT-J-17-4579
Agency: Brno University of Technology
Program: Vnitřní projekty VUT
Sekvenování pomocí nanopórových technologií a jejich použití v praxi se postupně stává běžnou realitou. Jejich potenciálu plného využití na poli metagenomiky ovšem zabraňuje nedostatek dostupných bioinformatických nástrojů. Cílem je vytvoření komplexní automatizované metodiky pro taxonomickou identifikaci sekvencí získaných nanopórovým sekvenováním metagenomických vzorků. Projekt bude prvním svého druhu pro klasifikaci metagenomických dat přímo ze signálových sekvencí bez nutnosti prvotního převedení na klasický znakový řetězec DNA.
Hon Jiří, Ing., Ph.D.
Provazník Valentýna, prof. Ing., Ph.D. (UBMI)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS)