Detail produktu
SoluProtMutDB
Vznik: 2022
Hamšíková Marie
Štourač Jan
Musil Miloš, Ing., Ph.D. (UIFS)
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (UMEL)
Bednář David
Mazurenko Stanislav, Ph.D.
stabilní data, proteinové inženýrství, stabilizace proteinů, stabilní mutace
SoluProtMutDB je první databáze obsahující data o změnách rozpustnosti proteinů
po mutacích. Naše databáze obsahuje 33 000 měření 17 000 variant proteinů ve 103
různých proteinech. Databáze může sloužit jako základní zdroj informací pro
výzkumníky, kteří navrhují vylepšené varianty proteinů, nebo pro ty, kteří
vyvíjejí nástroje využívající strojového učení k předpovídání účinků mutací na
rozpustnost. Databáze obsahuje všechny dříve publikovaná data o rozpustnosti
a tisíce nových datových bodů z nedávných publikací, včetně experimentů se
skenováním hlubokých mutací. Navíc obsahuje mnoho dostupných experimentálních
podmínek, o kterých je známo, že ovlivňují rozpustnost proteinu. Datové sady byly
ručně upraveny s podstatnými opravami, což zlepšilo vhodnost pro aplikace
strojového učení. Databáze je dostupná na loschmidt.chemi.muni.cz/soluprotmutdb.
Databáze je zdarma dostupná na https://loschmidt.chemi.muni.cz/soluprotmutdb/.