Detail produktu
FireProt
Vznik: 2016
Štourač Jan (FIT)
Bendl Jaroslav, Ing., Ph.D.
Brezovský Jan (FIT)
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS)
Prokop Zbyněk (FIT)
Bednář David (FIT)
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (UMEL)
proteinové inženýrství, thermostabilní proteiny, vícebodoví mutanti, stabilita proteinů
FireProt je webový nástroj pro automatický návrh thermostabilních proteinů. Návrh thermostabilních proteinů je založen na využití sekvenčních a strukturních informací získaných z několika bioinformatických databází a výpočetních nástrojů. FireProt kombinuje evoluční a energetické přístupy společně s několika filtry, které urychlují výpočet opomíjením potenciálně škodlivých mutací. V rámci svého workflow, FireProt integruje 16 výpočetních nástrojů, využívajících jak sekvenční tak strukturní informace. FireProt poskytuje uživatelům one-stop-shop řešení pro design thermostabilních proteinů, sestavených třemi rozličnými strategiemi. Server navíc umožňuje uživatelům vložit jimi definované mutace do již sestaveného thermostabilního proteinu a vygenerovat si odpovídající sekvenci ve formátu FASTA.
Nástroj je dostupný na internetové adrese: http://loschmidt.chemi.muni.cz/fireprot
Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Radka Báčová, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 473.