Detail výsledku

FireProt web

Vznik: 2016
Typ
software
Jazyk
angličtina
Autoři
Musil Miloš, Ing., Ph.D., UIFS (FIT)
Štourač Jan, FIT (FIT)
Bendl Jaroslav, Ing., Ph.D.
Brezovský Jan, FIT (FIT)
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D., UPSY (FIT)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc., UIFS (FIT)
Prokop Zbyněk
Bednář David
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr., UMEL (FEKT)
Popis

FireProt is a web server for an automated design of thermostable mutants. The design of thermostable mutants is based on integration of structural and evolutionary infromation obtained from several bioinfromatics databases and computational tools.
FireProt strategy combines energy and evolution based approaches together with several filters that accelerate the calculation by omitting potentially deleterious mutations. Within its workflow, FireProt integrates 16 computational tools, utilizing both sequence and structural information in the process. FIreProt web server provides users with a one-stop-shop solution for the design of thermostable proteins, constructed by three distinct strategies. Futhermore, the server allows users to include user-defined mutations into the constructed thermostable protein and generate corresponding sequences in the FASTA format.

Klíčová slova

protein engineering, thermostable proteins, multiple-point mutants, protein stability

Umístění

Nástroj je dostupný na internetové adrese: http://loschmidt.chemi.muni.cz/fireprot

Licence
Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence
Licenční poplatek
Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek
Licenční podmínky

Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Radka Báčová, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 473.

Projekty
Výzkum pokročilých metod ICT a jejich aplikace, VUT, Vnitřní projekty VUT, FIT-S-14-2299, zahájení: 2014-01-01, ukončení: 2016-12-31, ukončen
Výzkumné skupiny
Pracoviště
Nahoru