Detail publikace

Clustering of Protein Sequences

BURGETOVÁ, I.; ZENDULKA, J. Clustering of Protein Sequences. In Proceedings of 1st International Workshop WFM'06. Přerov: 2006. p. 71-78. ISBN: 80-86840-20-4.
Název česky
Shlukování proteinových sekvencí
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
anglicky
Autoři
Burgetová Ivana, Ing., Ph.D. (UIFS)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS)
Klíčová slova

proteinové sekvence, optimální yarovnání dvou proteinových sekvencí, konečné automaty, shlukování, podobnostní funkce

Abstrakt

Jednou z metod, jejiž výsledky mohou být využity pro predikci struktury proteinů, je shlukování proteinových sekvencí. Shlukovací metody rozdělují objekty do tříd na základě podobnosti. Podobnost dvou proteinových sekvencí může být určena na základě skóre optimálního zarovnání dvou proteinových sekvencí. Tento článek je zaměřen na využití formálních modelů pro popis problému shlukování proteinových sekvencí. Je zde popsán Needleman-Wunsch algoritmus pro nalezení skóre optimálního zarovnání dvou proteinových sekvencí a konečný automat, který umožní výpočet tohoto skóre.

Rok
2006
Strany
71–78
Sborník
Proceedings of 1st International Workshop WFM'06
ISBN
80-86840-20-4
Místo
Přerov
BibTeX 
@inproceedings{BUT34269,
  author="Ivana {Burgetová} and Jaroslav {Zendulka}",
  title="Clustering of Protein Sequences",
  booktitle="Proceedings of 1st International Workshop WFM'06",
  year="2006",
  pages="71--78",
  address="Přerov",
  isbn="80-86840-20-4"
}
Nahoru