Detail publikace

Combined Density- and Grid- Based Method for Clustering of Protein Substructures

BURGETOVÁ, I. Combined Density- and Grid- Based Method for Clustering of Protein Substructures. ZNALOSTI 2009, Proceedings of the 8th annual conference. Brno: Vydavateľstvo STU, 2009. p. 201-212. ISBN: 978-80-227-3015-0.
Název česky
Kombinovaná metoda pro shlukování proteinových substruktur
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
anglicky
Autoři
Burgetová Ivana, Ing., Ph.D. (UIFS)
Klíčová slova

Cluster analysis, data mining, PDB, sequence-structure fragments, protein structure prediction

Abstrakt

Techniky pro dolování dat umožňují získat zajímavé informace z rozsáhlých databází, a proto se velmi často využívají v bioinformatice při analýze biologických dat. V naší práci se zabýváme dolováním dat z databáze PDB - Protein Data Bank. Pomocí shlukové analýzy hledáme proteinové sekvence, které se vyskytují v omezeném počtu různých strkturních konformací. Znalosti o takových proteinových fragmentech lze využít pro predikci struktury proteinů. V tomto příspěvku představujeme novou kombinovanou metodu pro shlukování proteinových substruktur.

Rok
2009
Strany
201–212
Sborník
ZNALOSTI 2009, Proceedings of the 8th annual conference
ISBN
978-80-227-3015-0
Vydavatel
Vydavateľstvo STU
Místo
Brno
BibTeX 
@inproceedings{BUT30201,
  author="Ivana {Burgetová}",
  title="Combined Density- and Grid- Based Method for Clustering of Protein Substructures",
  booktitle="ZNALOSTI 2009, Proceedings of the 8th annual conference",
  year="2009",
  pages="201--212",
  publisher="Vydavateľstvo STU",
  address="Brno",
  isbn="978-80-227-3015-0"
}
Nahoru