Detail publikace

Abstraction-based segmental simulation of reaction networks using adaptive memoization

HELFRICH, M.; ANDRIUSHCHENKO, R.; ČEŠKA, M.; KŘETÍNSKÝ, J.; MARTIČEK, Š.; ŠAFRÁNEK, D. Abstraction-based segmental simulation of reaction networks using adaptive memoization. BMC BIOINFORMATICS, 2024, vol. 25, no. 1, p. 1-24. ISSN: 1471-2105.
Název česky
Simulace chemických reakčních sítí pomocí abstracke a segmentace
Typ
článek v časopise
Jazyk
anglicky
Autoři
Helfrich Martin
Andriushchenko Roman, Ing. (UITS)
Češka Milan, doc. RNDr., Ph.D. (UITS)
KŘETÍNSKÝ, J.
Martiček Štefan, Ing.
Šafránek David, doc. Mgr., Ph.D.
URL
Klíčová slova

reakční síť, stochastická simulace, populační abstrakce

Abstrakt

Tento článek navrhuje novou metodu pro simulaci složitých chemických reakčních
sítí. Navržená metoda je založená na populační abstrakci a segmentaci.
Experimentální výsledky ukazují, že metoda výrazně urychluje generování
trajektorií složitých stochastických systémů.

Rok
2024
Strany
1–24
Časopis
BMC BIOINFORMATICS, roč. 25, č. 1, ISSN 1471-2105
DOI
10.1186/s12859-024-05966-5
UT WoS
001351556400001
EID Scopus
2-s2.0-85209476640
BibTeX 
@article{BUT193584,
  author="HELFRICH, M. and ANDRIUSHCHENKO, R. and ČEŠKA, M. and KŘETÍNSKÝ, J. and MARTIČEK, Š. and ŠAFRÁNEK, D.",
  title="Abstraction-based segmental simulation of reaction networks using adaptive memoization",
  journal="BMC BIOINFORMATICS",
  year="2024",
  volume="25",
  number="1",
  pages="1--24",
  doi="10.1186/s12859-024-05966-5",
  issn="1471-2105",
  url="https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-024-05966-5"
}
Nahoru