Detail publikace

Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression

ZWINSOVÁ, B.; PETROV, V.; HRIVŇÁKOVÁ, M.; SMATANA, S.; MICENKOVÁ, L.; KAZDOVÁ, N.; POPOVICI, V.; HRSTKA, R.; ŠEFR, R.; BENCSIKOVÁ, B.; ZDRAŽILOVÁ-DUBSKÁ, L.; BRYCHTOVÁ, V.; NENUTIL, R.; VÍDEŇSKÁ, P.; BUDINSKÁ, E. Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression. Cancers, 2021, vol. 13, no. 19, p. 1-25. ISSN: 2072-6694.
Název česky
Mikrobiom sliznice kolorektálního nádoru je obohacen o orální patogeny a definuje tři podtypy, které korelují s markery progrese nádoru
Typ
článek v časopise
Jazyk
anglicky
Autoři
ZWINSOVÁ, B.
PETROV, V.
HRIVŇÁKOVÁ, M.
Smatana Stanislav, Ing.
MICENKOVÁ, L.
KAZDOVÁ, N.
POPOVICI, V.
HRSTKA, R.
ŠEFR, R.
BENCSIKOVÁ, B.
ZDRAŽILOVÁ-DUBSKÁ, L.
BRYCHTOVÁ, V.
NENUTIL, R.
VÍDEŇSKÁ, P.
BUDINSKÁ, E.
URL
Klíčová slova

Gen 16S rRNA, Kolorektální karcinom, Mikrobiální podtypy, Nádorový mikrobiom

Abstrakt

Dlouhodobá dysbióza střevního mikrobiomu má významný vliv na progresi kolorektálního karcinomu (CRC) a vysvětluje část pozorované heterogenity onemocnění. I když byly popsány posuny ve střevním mikrobiomu v sekvenci normálního adenomu a karcinomu, krajina mikrobiomu v rámci CRC a její asociace s klinickými proměnnými zůstávají nedostatečně prozkoumány. Provedli jsme sekvenování genu 16S rRNA párové nádorové tkáně, přilehlé vizuálně normální sliznice a výtěrů stolice 178 pacientů s CRC stadia 0IV, abychom popsali mikrobiom nádoru a jeho asociaci s klinickými proměnnými. Identifikovali jsme nové rody asociované buď s nádorovou sliznicí CRC nebo CRC obecně. V nádorové sliznici dominovaly rody patřící k orálním patogenům. Na základě nádorového mikrobiomu jsme rozvrstvili pacienty s CRC do tří podtypů, které byly významně spojeny s prognostickými faktory, jako je grade nádoru, stranovost a staging TNM, mutace BRAF a stav MSI. Zjistili jsme, že mikrobiom CRC silně koreluje se stupněm, umístěním a stádiem, ale tyto asociace jsou závislé na mikrobiálním prostředí. Naše studie otevírá nové možnosti výzkumu v detekci progrese onemocnění biomarkerem mikrobiomu CRC a zároveň identifikuje jeho omezení, což naznačuje potřebu kombinace několika míst odběru vzorků (např. stolice a výtěry z nádorů).

Rok
2021
Strany
1–25
Časopis
Cancers, roč. 13, č. 19, ISSN 2072-6694
DOI
10.3390/cancers13194799
UT WoS
000773923000016
EID Scopus
2-s2.0-85115786809
BibTeX 
@article{BUT182946,
  author="ZWINSOVÁ, B. and PETROV, V. and HRIVŇÁKOVÁ, M. and SMATANA, S. and MICENKOVÁ, L. and KAZDOVÁ, N. and POPOVICI, V. and HRSTKA, R. and ŠEFR, R. and BENCSIKOVÁ, B. and ZDRAŽILOVÁ-DUBSKÁ, L. and BRYCHTOVÁ, V. and NENUTIL, R. and VÍDEŇSKÁ, P. and BUDINSKÁ, E.",
  title="Colorectal tumour mucosa microbiome is enriched in oral pathogens and defines three subtypes that correlate with markers of tumour progression",
  journal="Cancers",
  year="2021",
  volume="13",
  number="19",
  pages="1--25",
  doi="10.3390/cancers13194799",
  issn="2072-6694",
  url="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8507728/"
}
Nahoru