Detail publikace

Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases

ZÁMOCKÝ, M.; MUSIL, M.; BANCHENKO, M.; FERIANC, P.; CHOVANOVÁ, K.; BARÁTH, P.; POLJOVKA, A.; BEDNÁŘ, D. Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases. Biology, 2022, vol. 11, no. 3, p. 1-18. ISSN: 2079-7737.
Název česky
Náhled do specifického vývoje houbových hybridních B hemperoxidáz
Typ
článek v časopise
Jazyk
anglicky
Autoři
Zámocký Marcel
Musil Miloš, Ing., Ph.D. (UIFS)
Banchenko Maksym
Ferianc Peter
Chovanová Katarína
Baráth Peter
Poljovka Andrej
Bednář David (FIT)
URL
Klíčová slova

hybrid B hemperoxidáza, superrodina peroxidázakataláza, oxidační stres, enzymatický antioxidant, ancestrální rekonstrukce

Abstrakt

V této studii se zaměřujeme na podrobnou bioinformatickou analýzu genů hyBpox, zejména v genomech Sclerotiniaceae (Ascomycota, Leotiomycetes), což je specificky vyvinutá rodina hub nekrotrofních hostitelských generalistů a specialistů na saprofytické nebo biotrofní hostitele. Zástupci rodu Sclerotium produkují pouze sklerocia a žádné plodnice nebo výtrusy. Jejich fyziologická úloha pro peroxidázy tedy zůstává otevřená. Reprezentativní druh, S. cepivorum, je nebezpečný rostlinný patogen způsobující bílou hnilobu u druhů Allium, zejména u cibule, pórku a česneku. V celosvětovém měřítku je bílá hniloba způsobená touto půdní houbou zřejmě nejvážnější hrozbou pro produkci Allium. Také jsme našli velmi podobné sekvence peroxidázy v příbuzné houbě S. sclerotiorum, i když s malými, ale důležitými modifikacemi v architektuře jejího aktivního centra. Přítomnost mRNA specifické pro ScephyBpox1 byla potvrzena transkriptomickou analýzou. Přítomnost Hybrid B peroxidázy na úrovni proteinu jako jediné extracelulární peroxidázy této houby byla potvrzena v sekretomu S. cepivorum pomocí podrobných proteomických analýz. To nás přimělo systematicky hledat všechny dostupné geny kódující Hybridní B hem peroxidázy v celé houbové rodině Sclerotiniaceae. Uvádíme zde rekonstrukci jejich molekulární fylogeneze a analyzujeme jedinečné aspekty jejich rysů konzervovaných sekvencí a strukturních záhybů v odpovídajících sekvencích předků.

Rok
2022
Strany
1–18
Časopis
Biology, roč. 11, č. 3, ISSN 2079-7737
DOI
10.3390/biology11030459
UT WoS
000776175200001
EID Scopus
2-s2.0-85127589607
BibTeX 
@article{BUT177747,
  author="Marcel {Zámocký} and Miloš {Musil} and Maksym {Banchenko} and Peter {Ferianc} and Katarína {Chovanová} and Peter {Baráth} and Andrej {Poljovka} and David {Bednář}",
  title="Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases",
  journal="Biology",
  year="2022",
  volume="11",
  number="3",
  pages="1--18",
  doi="10.3390/biology11030459",
  issn="2079-7737",
  url="https://www.mdpi.com/2079-7737/11/3/459"
}
Nahoru