Administration of the Probiotic Escherichia coli Strain A0 34/86 Resulted in a Stable Colonization of the Human Intestine During the First Year of Life

• https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs12602-019-09548-3

E. coli, Enterobacteriaceae, Probiotic, Colinfant, Sequencing

Colinfant New Born (CNB) je orálně podávané probiotikum obsahující bakterii Escherichia coli kmen  A0 34/86, který je  prezentován jako vhodný pro novorozence a kojence. I když byl dopad užívání různých probiotik na skladbu střevního mikrobiomu zdokumentován i v minulosti, dopady probiotik obsahujících E. coli na kojenecký mikrobiom nebyl doposud zkoumán.  Dopad orálně podávaného CNB na populaci Enterobacteriaceae byl zmapován pomocí sekvencování genu 16s rRNA ve vzorcích DNA izolovaných ze stolice kojence, které byly odebrány v 177 různých časových bodech po dobu prvního roku života. Abundance kmenu E. coli byla analyzována za pomoci detekce 26 genetických determinantů, fyloskupin a analýzy za pomoci gelové elektroforézy (PFGE). Podání CNB po dobu druhého a třetího měsíce života způsobilo začlenění rodu Escherichia do střevního traktu a Escherichia se stala dominantním rodem z rodiny Enterobacteriaceae (p<0.01). Genetické determinanty, typické pro probiotikum E. coli A0 kmen 34/86, byly zjišteny v průběhu prvního dne po aplikaci probiotika a přetrvaly po dobu celého roku. Navíc bylo identifikováno i devět tranzientních kmenu E. coli, které vykazovaly odlišné genetické determinanty a odlišné profily PFGE. Tranzientní kmeny byly zjištěny od 2 do 24 dní ve vzorcích stolice. První kolonie z rodu Escherichia pocházela z podání probiotika CNB. Probiotikum E. coli A0 34/86 úspěšně kolonizovalo zažívací trakt kojence a přetrvalo po dobu prvního roku života.