Detail publikace

The slowdown of Y chromosome expansion in dioecious Silene latifolia due to DNA loss and male-specific silencing of retrotransposons.

PUTEROVÁ, J.; KUBÁT, Z.; KEJNOVSKÝ, E.; JESIONEK, W.; ČÍŽKOVÁ, J.; VYSKOT, B.; HOBZA, R. The slowdown of Y chromosome expansion in dioecious Silene latifolia due to DNA loss and male-specific silencing of retrotransposons. BMC GENOMICS, 2018, vol. 19, no. 153, p. 1-11. ISSN: 1471-2164.
Název česky
Zpomalení expanze chromozomu Y u dvojdomé rostliny Silene latifolia způsobené ztrátou DNA a specifickým tlumením retrotransposonů u samců.
Typ
článek v časopise
Jazyk
anglicky
Autoři
Puterová Janka, Ing., Ph.D. (FIT)
Kubát Zdeněk (FIT)
Kejnovský Eduard, doc. RNDr., CSc.
Jesionek Wojciech (FIT)
Čížková Jana (FIT)
Vyskot Boris, prof. RNDr., DrSc.
Hobza Roman (FIT)
URL
Klíčová slova

epigenetika, velikost genomu, Silene latifolia, transpozibilni elementy, Y chromozom

Abstrakt

Vzestup a pád Y chromozomu byl prokázán u zvířat, ale rostliny často obsahují ve lký, evolučně mladý chromozom Y, o kterém se myslí, že expandoval jen nedávno. Z lomové události oddělující fáze zvětšování a smršťování u evoluce rostlinného Y  chromozomu je ještě potřebné určit. K posouzení dynamiky velikosti chromozomu Y  jsme studovali vnitrodruhovou variaci velikosti genomu a genomové kompozice samč ích a samičích jedinců u dvojdomé rostliny Silene latifolia, která je dobře zave dený model pro studium vývoje pohlavních chromozomů. Data o velikosti genomu jso u první, která demonstrují, že bez ohledu na vnitrodruhovou variaci velikosti ge nomu, Y chromozom jsi u S. latifolia zachoval svou velikost. Bioinformatická stu die složení genomu ukázala, že stálost velikosti chromozomu Y byla způsobena ztr átou DNA z Y chromozomu a proliferací nedávno aktivních dominantních retrotransp osonů specifickou pro samičky. Ukazujeme, že některé rodiny retrotransposonů při spěly ke změně velikosti genomu, ale nikoliv ke změně velikosti chromozomu Y. Naše výsledky naznačují, že velký Y chromozom S. latifolia zpomalil nebo zastavi l svou expanzi. Proliferace retrotransposonů specifická pro samičky zvětšujícíge nom s výjimkou chromozomu Y, byla pravděpodobně způsobena tlumením vysoce aktivn ích retrotransposonů u samečků a představuje adaptivní mechanismus potlačující d egenerativní procesy v haploidním stadiu. Pohlavně specifické tlumení transposon ů by mohlo být rozšířené v rostlinách, ale skryto u tradičních rostlin s hermafr oditickým modelem.

Rok
2018
Strany
1–11
Časopis
BMC GENOMICS, roč. 19, č. 153, ISSN 1471-2164
DOI
10.1186/s12864-018-4547-7
UT WoS
000425519100005
EID Scopus
2-s2.0-85042165020
BibTeX 
@article{BUT146269,
  author="Janka {Puterová} and Zdeněk {Kubát} and Eduard {Kejnovský} and Wojciech {Jesionek} and Jana {Čížková} and Boris {Vyskot} and Roman {Hobza}",
  title="The slowdown of Y chromosome expansion in dioecious Silene latifolia due to DNA loss and male-specific silencing of retrotransposons.",
  journal="BMC GENOMICS",
  year="2018",
  volume="19",
  number="153",
  pages="1--11",
  doi="10.1186/s12864-018-4547-7",
  issn="1471-2164",
  url="https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4547-7"
}
Nahoru