Detail publikace
Maximizing the Efficiency of Multi-enzyme Process by Stoichiometry Optimization
Kurumbang Nagendra, Ph.D. (LL)
Bendl Jaroslav, Ing., Ph.D. (FIT VUT)
Brezovský Jan, Mgr., Ph.D. (LL)
Prokop Zbyněk, doc. RnDr., Ph.D. (LL)
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (LL)
biokatalýza, biotransformace, kinetické modelování
Multi-enzymové procesy reprezentují důležitou oblast biokatalýzy. Jejich efektivita může být zlepšena optimalizací biokatalytické stechiometrie. V tomto článku prezentujeme worfklow pro maximalizaci efektivity tří-enzymového systému katalyzujícího pěti-krokovou chemickou konverzi. Kinetické modely dráhy popisují buď wild-type nebo inženýrované enzymy byly vytvořeny a stechiometrie enzymů každé dráhy byla optimalizována. Matematické modelování a laboratorní experimenty poskytly detalní vhled do dynamiky dráhy, což umožnilo výběr vhodného inženýrovaného (vylepšeného) enzymu a zlepšilo efektivitu, zatímco snížilo množství potřebného biologického materiálu. Optimalizace stechiometrie v dráze inženýrovaného enzymu snížilo celkové množství potřebného biologického materiálu o úctyhodných 56%. Naše workflow představuje široce aplikovatelnou strategii pro optimalizaci multi-enzymových procesů.
@ARTICLE{FITPUB10595, author = "Pavel Dvo\v{r}\'{a}k and Nagendra Kurumbang and Jaroslav Bendl and Jan Brezovsk\'{y} and Zbyn\v{e}k Prokop and Ji\v{r}\'{i} Damborsk\'{y}", title = "Maximizing the Efficiency of Multi-enzyme Process by Stoichiometry Optimization", pages = "1891--1895", journal = "ChemBioChem", volume = 15, number = 13, year = 2014, ISSN = "1439-4227", doi = "10.1002/cbic.201402265", language = "english", url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/10595" }