Identification of palindrome-forming sequences

Identifikace sekvencí tvořících palindromatické struktury

software

Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek

Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (UPSY)

Palindrome, DNA, dynamic programming.

Tento program slouží pro vyhledávání specifické sekundární struktur tzv. palindromů v DNA sekvencích. Program je založen na technice dynamického programování a oproti ostatním přístupům je schopen detekovat palindromy obsahující chyby ve formě záměny odstranění nebo vložení znaku.

Stažením tohoto softwaru (viz též výše uvedený odkaz) uživatel vyjadřuje souhlas s licenčními podmínkami.

http://www.fit.vutbr.cz/research/view_product.php?id=195&notitle=1

Volně šiřitelný software poskytovaný pod licencí BSD (přesné znění licence je dostupné na stránce http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php).

• gz paldpl.tar.gz 4 kB

Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA, GAČR, Standardní projekty, GA204/08/1560, zahájení: 2008-04-01, ukončení: 2010-12-31, ukončen
Výzkum informačních technologií z hlediska bezpečnosti, MŠMT, Institucionální prostředky SR ČR (např. VZ, VC), MSM0021630528, zahájení: 2007-01-01, ukončení: 2013-12-31, řešení

Fakulta informačních technologií (FIT)