Detail produktu
pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences
Vznik: 2016
Název česky
pqsfinder: R/Bioconductor balíček pro identifikaci sekvencí tvořících kvadruplexy
Typ
software
Licence
Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence
Licenční poplatek
Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje licenční poplatek
Autoři
Hon Jiří, Ing., Ph.D.
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (UPSY)
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (UPSY)
Martínek Tomáš, doc. Ing., Ph.D. (UPSY)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS)
Klíčová slova
G-kvadruplex; kvadruplex; DNA; R; Bioconductor; rozpoznávání vzorů; vyhledávání; anotace
Popis
Tento balíček poskytuje funkce pro identifikaci sekvencí DNA, které se pravděpodobně skládají do tvaru intramolekulárního G-kvadruplexu. Na rozdíl od konkurenčních řešení je tento balíček schopen detekovat sekvence nedokonalých kvadruplexů obsahující např. neshody nebo výdutě.
Umístění
Licenční podmínky
Volně šiřitelný software poskytovaný pod licencí BSD (přesné znění licence je dostupné na stránce http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php).
Projekty
Výzkum pokročilých metod ICT a jejich aplikace, VUT, Vnitřní projekty VUT, FIT-S-14-2299, zahájení: 2014-01-01, ukončení: 2016-12-31, ukončen
Pracoviště