Course details

Structural biology

BI9410 Acad. year 2016/2017 Winter semester

Current academic year

Course is not open in this year

Item has no anotation.

Guarantor

Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr.

Language of instruction

Czech

Completion

Examination (written)

Time span

  • 26 hrs lectures
  • 26 hrs exercises

Assessment points

  • 100 pts final exam

Department

Přírodovědecká fakulta (PřF MU)

Subject specific learning outcomes and competences

Item has no knowledges.

Learning objectives

Item has no goals.

Prerequisite knowledge and skills

There are no prerequisites

Syllabus of lectures

  1. Struktura biologických makromolekul - složení, metody stanovení, využití v biologii, vizualizace.
  2. Databáze experimentálních struktur - získání a hodnocení struktur makromolekul, vybrané strukturní databáze.
  3. Modely struktur - databáze modelů, metody hodnoceni kvality modelů, příprava modelů.
  4. Stabilita a dynamika makromolekul - analýza stability a dynamiky a jejich databáze.
  5. Analýza struktury proteinu - identifikace důležitých regionů: vazebná/aktivní místa, transportní cesty, flexibilní regiony, katalytické aminokyseliny.
  6. Predikce struktury makromolekulárních komplexů.
  7. Komplexy protein-protein - hodnocení komplexu, analýza interakcí a jejich databáze.
  8. Komplexy protein-DNA - hodnocení komplexu, analýza interakcí a jejich databáze.
  9. Komplexy protein-ligand - hodnocení komplexu, analýza interakcí a jejich databáze.
  10. Modifikace struktury proteinu - stanovení vlivu mutace na strukturu a funkci proteinu.
  11. Aplikace strukturní biologie - biologický výzkum, hledání nových léčiv, design biokatalyzátorů.

Progress assessment

Study evaluation is based on marks obtained for specified items. Minimimum number of marks to pass is 50.

Controlled instruction

There are no checked study.

Back to top